单细胞联合组学

步骤1、样品准备

从细胞培养物、原代细胞、新鲜或冷冻组织中分离出的细胞核悬浮液开始。

步骤2、构建10X测序文库

使用10X公司的配套试剂盒和单细胞分选平台构建单细胞基因表达和ATAC测序cDNA文库，首先将单细胞核混合在一起，然后使用10X单细胞分选仪对单细胞核制备凝胶珠封装。mRNA和转置的DNA片段都用10x条形码标记，每个条形码序列代表同一个独特的细胞。

步骤3、文库测序

由此产生的10x条形码单细胞基因表达和ATAC-seq库与Illumina测序仪上的标准NGS短读测序兼容，可大规模并行分析数千个单个细胞。

步骤4、数据分析

10X公司的Cell Ranger ARC分析软件为每个细胞生成开放染色质和基因表达谱，识别具有类似谱的细胞群，并计算开放染色质峰和基因表达之间的联系。

步骤5、数据可视化

使用Loupe Browser可视化软件交互式探索实验结果，比较不同细胞类型和状态的染色质开放性和基因表达，并研究染色质开放峰和基因表达之间联系的生物学意义。

步骤6、个性化分析

我们元信生物为各位科研工作者提供基于单细胞转录组和单细胞ATAC数据的各种高级的个性化分析。